Organización interna
El director ejecuta los acuerdos del Consejo de Unidad Académica (CUA), ya que el Instituto funciona a través de un liderazgo colectivo. El CUA está formado por representantes que se eligen desde las bases de sus centros y departamentos, los cuales participan directamente con propuestas, análisis y discusión a fondo. A través del CUA y de la Comisión de Elaboración y Seguimiento del Plan de Desarrollo del ICUAP se establecen las metas a futuro, a través de esta dirección colegiada.
Directores del ICUAP desde 1974
Desde su fundación el ICUAP ha tenido diez directores, el primero fue el Ing. Luis rivera Terrazas, su fundador en 1974 y actualmente la directora es la Dra. Carolina Morán Raya, como se muestra enseguida: