Posgrados
El ICUAP ofrece 10 posgrados, cuatro doctorados y seis maestrías, todos orientados a la investigación. Nueve pertenecen al Padrón Nacional de Posgrados de Calidad (PNPC) del CONACYT. En estos programas están inscritos 341 alumnos, 175 en doctorado y 166 en maestría.
Las particularidades de cada posgrado se detallan en el apartado correspondiente.
Licenciaturas
El ICUAP es corresponsable en cuatro programas educativos de licenciatura:
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Licenciatura en Biomedicina de la Facultad de Medicina, donde el Centro de Investigaciones en Ciencias Microbiológicas es responsable del eje terminal de Microbiología.
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Licenciatura en Biotecnología adscrita a la Facultad de Ciencias Biológicas, donde participan profesores de diferentes Centros y Departamentos del Instituto en colaboración con profesores de la Facultad de Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias Químicas, Herbario y Jardín Botánico Universitario, y de la Facultad de Ingeniería Química.
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Licenciatura en Energías Renovables.
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Licenciatura en Sistemas Automotrices de la Facultad de Ciencias de la Electrónica, en estas dos últimas licenciaturas participan desde la elaboración del proyecto, Profesores Investigadores del Centro de Investigación en Dispositivos Semiconductores y del Centro de Química.